一、团队介绍
利用生物信息学技术研究主要农作物的基因组、转录组、代谢组和表型组特征及其相互关系，挖掘作物关键功能基因、理清功能基因调控网络，同时构建机器学习模型并应用于作物子代基因组预测和种质创制。
二、研究内容
1.二代测序数据分析；
2.分子标记开发与利用；
3.控制重要性状基因的网络解析和图位克隆。
三、团队组成
团队负责人：徐照龙
团队成员：杜建厂、袁娜、黄益洪、许莹修
四、研究基础
序号 | 合同起止时间 | 主持人 | 项目类别 | 项目名称 |
1 | 2020-2022 | 袁娜 | 江苏省农业科技自主创新资金 | 基于 CACTA 转座子插入多态性的新型分子标记研发及在食用 豆类种质资源鉴定中的创新应用 |
2 | 2019-2021 | 袁娜 | 国家自然科学青年基金 | 东亚陆桥岛屿片断化的遗传学效应研究：以金毛耳草为例 |
3 | 2017-2020 | 徐照龙 | 国家自然科学青年基金 | 大豆GmMCU1基因响应盐胁迫的作用机制研究 |
4 | 2017-2020 | 徐照龙 | 江苏省农科院创新基金 | 大豆GmMCU1基因响应盐胁迫的作用机制研究 |
5 | 2017-2020 | 袁娜 | 江苏省自然科学青年基金 | 多肽 GaPR10pep 抗黄萎病的功能分析及应用研究 |
6 | 2016-2018 | 徐照龙 | 江苏省农业生物学重点实验室项目 | 大豆响应盐胁迫MCU类基因鉴定及MCU5功能解析 |
7 | 2014-2017 | 杜建厂 | 国家自然科学基金 | 大豆转座子特殊转座规律的研究 |
8 | 2014-2016 | 徐照龙 | 江苏省科技厅盐土重点实验室项目 | 大豆转录因子WRKY49耐盐机理研究 |
9 | 2012-2015 | 杜建厂 | 人社部留学回国人员启动基金 | 大豆抗病基因全基因组挖掘与遗传多样性研究 |
10 | 2013-2015 | 杜建厂 | 省333人才工程 | 棉花基因组深度解析及分子标记辅助育种技术研究 |
11 | 2012-2014 | 杜建厂 | 省六大人才高峰 | 基于重测序技术的大豆重要农艺性状相关基因的克隆及在分子育种中的应用 |
12 | 2011-2014 | 杜建厂 | 院引进人才启动基金 | 生物信息平台建设 |
13 | 2011-2013 | 杜建厂 | 江苏省农业科技自主创新资金 | 大豆、油菜等重要经济作物基因组组分分析与遗传变异规律研究 |
五、代表性成果
发表文章
文章链接：https://www.eurekaselect.com/170256/article
文章链接：https://link.springer.com/article/10.1007/s11427-018-9360-0
文章链接：https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2018.00809/full
文章链接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.13541
文章链接：https://academic.oup.com/database/article/doi/10.1093/database/bax013/3084694
文章链接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.12398
六、对外合作与交流
国内合作：
与南京农业大学、江苏大学，中国科学院东北地理生态所等单位在学术研讨、课题申请、人员交流和联合研究等方面保持着密切的合作关系。
国际合作：
与美国美国普度大学、意大利米兰大学、日本熊本大学大学等多所国际知名研究机构合作开展人才培养和应用基础理论合作研究。近5年来，派出2名研究人员赴海外开展访问交流活动，共同发表研究成果和专利申请。