院玉米研究中心：近年来依托国家自然基金、农业部科技部等专项，以项目和技术为纽带，与中国农业大学、南京农业大学、上海大学，北京农林科学院等单位在学术研讨、课题申请、人员交流和联合研究等方面保持着密切的合作关系。

小麦种质资源创新团队：近年来依托国家重点研发计划、国家自然科学基金、农业部转基因专项等，以项目和技术为纽带，与中国农业科学院作物科学研究所、中国农业大学、南京农业大学、四川农业大学、河南大学等单位在学术研讨、课题申请、人员交流和联合研究等方面保持着密切的合作关系。

水稻种质资源创新团队：近年来与北京大学、中国农业科学院、南京农业大学、中国水稻研究所、中国科学院分子植物科学卓越创新中心等单位在学术研讨、课题申请、人员交流和联合研究等方面保持着密切的合作关系。

种质资源保护团队：近年来团队依托承担课题和相关平台，与中国农业科学院作物科学研究所、南京农业大学、扬州大学、四川农业大学、西北农林科技大学、上海农业生物基因中心、浙江省农业科学院、安徽省农业科学院、广东省农业科学院、江苏里下河地区农科所、江苏徐淮地区淮阴农科所等单位保持着密切的合作关系。

植物品种保护与测试新技术研究：依托DUS测试指南研制和标准制定等项目，先后与南京农业大学、南京蔬菜花卉研究所、重庆市农科院、贵州省农科院、江苏农林职业技术学院、江苏沿海地区农科所和中科院江苏省植物研究所等单位在品种DUS测试、指南研制和标准制（修）定等方面保持着密切的合作关系。